現代のネットワーク社会の発展と共に生まれた仮想空間｢デジタルワールド｣。そこではデジタル生命体である｢デジタルモンスター｣が誕生し、ホストコンピュータ｢イグドラシル｣が世界の全てを管理していた。しかし、デジタルワールドの発展と共に古くなった世界を消去し新しい世界を創るため、全てのデジモンを消去するという恐怖の｢Ｘプログラム｣が｢イグドラシル｣により発動された･･･！ 今、デジタルワールドに史上最大の危機が迫る！！

(C)本郷あきよし･東映アニメーション･デジモンCGプロジェクト